Od początku istnienia SENER, jakość była jednym z priorytetów firmy, a dziś stanowi jeden z filarów działalności. Dzięki takiemu podejściu do jakości zostaliśmy pierwszą hiszpańską firmą inżynieryjną, w której system zarządzania jakością uzyskał certyfikat zgodności z normą ISO 9001 dla wszystkich obszarów działalności i oddziałów firmy.

Wszyscy pracownicy SENER angażują się w utrzymanie i nieustającą pracę nad poprawą jakości, w celu usatysfakcjonowania klientów firmy. Podwyższanie jakości odbywa się równolegle ze stałą poprawą bezpieczeństwa pracowników przy wszystkich projektach i realizacjach, z poszanowaniem środowiska naturalnego.

SENER używa własnego, zintegrowanego systemu zarządzania jakością, ochroną środowiska i bezpieczeństwem, dla którego przyznano certyfikat zgodności z międzynarodowymi normami ISO 14001:2004 (w zakresie zarządzania środowiskowego) i OHSAS 18001:2007 (w zakresie BHP).

System zarządzania jakością firmy SENER także otrzymał odpowiednie certyfikaty zgodnie z normami poszczególnych sektorów, na przykład najważniejszy w aeronautyce certyfikat EN 9100, PECAL/AQAP 2110 i PECAL/AQAP 160 dla projektów z zakresu obronności oraz ISO 13485:2004 dotyczący działalności medycznej. Zawsze, gdy wymaga tego charakter projektu, SENER stosuje odpowiednie normy dla danego sektora, np. normy ANSI, ASME i API w projektach przemysłowych, normy ECSS w projektach kosmicznych itp.